Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ndufb1P0DN34 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ndufb1P0DN34 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ndufb1P0DN34 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ndufb1P0DN34 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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