Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col4a2P08122 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col4a2P08122 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms