Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TnfP06804 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TnfP06804 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TnfP06804 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TnfP06804 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TnfP06804 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms