Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01678 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01678 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01678 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01678 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01678 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms