Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lancl1O89112 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lancl1O89112 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms