Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apaf1O88879 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apaf1O88879 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms