Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1O88746 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tom1O88746 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tom1O88746 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms