Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc28a2O88627 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms