Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms