Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nme6O88425 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme6O88425 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms