Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vti1bO88384 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vti1bO88384 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms