Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnt1O88346 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnt1O88346 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1182.6 ms