Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms