Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd46O88174 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms