Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgceO70258 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgceO70258 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgceO70258 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgceO70258 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgceO70258 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgceO70258 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms