Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChkbO55229 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChkbO55229 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms