Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rpl35aO55142 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rpl35aO55142 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl35aO55142 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rpl35aO55142 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rpl35aO55142 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl35aO55142 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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