Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap18O55128 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap18O55128 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms