Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms