Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrxO55103 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrxO55103 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrxO55103 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrxO55103 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrxO55103 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrxO55103 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PrxO55103 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrxO55103 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms