Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SlkO54988 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SlkO54988 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SlkO54988 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SlkO54988 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SlkO54988 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SlkO54988 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SlkO54988 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms