Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Socs5O54928 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms