Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp10aO54827 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp10aO54827 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms