Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffbO54788 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DffbO54788 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffbO54788 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffbO54788 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DffbO54788 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffbO54788 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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