Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DffaO54786 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DffaO54786 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DffaO54786 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DffaO54786 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms