Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx8O35652 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx8O35652 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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