Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edil3O35474 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edil3O35474 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms