Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppt2O35448 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms