Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms