Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d1bO35324 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d1bO35324 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms