Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad6O35182 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms