Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kcns1O35173 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kcns1O35173 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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