Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClockO08785 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ClockO08785 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ClockO08785 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ClockO08785 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClockO08785 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ClockO08785 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ClockO08785 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms