Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms