Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8857L7N291 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8857L7N291 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms