Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm4141K9J7H2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4141K9J7H2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms