Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm2056J3QQ02 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms