Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3099J3QPA5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3099J3QPA5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms