Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp616J3QN14 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp616J3QN14 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp616J3QN14 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp616J3QN14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp616J3QN14 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp616J3QN14 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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