Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Top6blJ3QMY9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms