Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms