Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdh19G5E8H9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rdh19G5E8H9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms