Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H5

Tpte, MCG118205, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpteG5E8H5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TpteG5E8H5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TpteG5E8H5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms