Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zc3h12bG3X9I7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms