Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Farp1F8VPU2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms