Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M1F7CXU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M1F7CXU4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms