Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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