Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms