Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm5861F6VCN9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5861F6VCN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5861F6VCN9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms