Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rnf165E9QAU8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rnf165E9QAU8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf165E9QAU8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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